Alors que ses parents se séparent, Miyori vient vivre chez ses grands-parents, aux abords d'une vieille forêt pleine de vie. Tentant de s'adapter à sa nouvelle vie, Miyori découvre qu'elle est la gardienne protectrice de cette forêt magique et qu'elle va devoir tout mettre en œuvre pour la sauver d'un projet de barrage qui engloutirait tous les alentours.
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